El Secretario General es el máximo responsable ejecutivo y como tal lleva a cabo los acuerdos y directrices de los órganos de gobierno. Nombrado por la Junta Directiva, dirige las áreas, departamentos técnicos y servicios internos de la organización.
El Comité Ejecutivo y la Junta Directiva de Foment del Treball aprobaron a principios de 2019 una nueva estructura organizativa, el objetivo fundamental es fortalecer la actividad de la patronal catalana como representante de las empresas ante las administraciones y los reguladores , según el programa de trabajo de la nueva Presidencia y de los nuevos Órganos de Gobierno de modernizar, rejuvenecer, feminizar, renovar y generar ilusión de futuro.